Auf der Grundlage aller Bewerbungen entscheidet die Deutsche SchülerAkademie über die Vergabe der Plätze.
Da die Bewerbungszahlen je Kurs erfahrungsgemäß erheblich schwanken, erfolgt die Kursvergabe u.a. nach folgenden Richtlinien:Ist für einzelne Kurse die Zahl der Bewerbungen höher als die Zahl der verfügbaren Plätze und lassen die erwähnten Auswahlprinzipien keine eindeutigen Entscheidungen zu, kann auch das Los entscheiden.
Da sich erfahrungsgemäß weit mehr Schülerinnen und Schüler für die Kurse bewerben, als Plätze vorhanden sind, muss damit gerechnet werden, dass nicht jede Empfehlung berücksichtigt werden kann. Im Jahr 2009 lag die Aufnahmequote bei 59 Prozent.
Die Ablehnung einer Bewerbung beinhaltet keinerlei Aussage über die Qualifikation des Bewerbers. Jeder, der zur Bewerbung aufgefordert wurde (z.B. aufgrund einer Empfehlung durch die Schule), wird hinsichtlich seiner Qualifikation bei der Platzvergabe gleichrangig behandelt.
Die Deutsche SchülerAkademie benachrichtigt die Bewerber Ende April über den Ausgang ihrer Bewerbung.